La misión del herbario de la Universidad Central del Ecuador como parte de un centro de educación superior y pedagógica, es crear y difundir conocimientos de investigación científica en las áreas de Botánica, Flora, Ecología, Etnobotánica, Conservación y otras relacionadas, además de custodiar la colección relevante que es parte de acervo patrimonial y lograr que las actuales y futuras generaciones conozcan y valoren la diversidad florística de nuestro país para su conservación ex situ y ser un centro que apoyo y trabajo colaborativamente con facultades organismos locales, nacionales e internacionales afines a la conservación, que se realiza con la enseñanza, la generación de información, asesoramiento técnico, gestión de proyectos y la prestación de servicios profesionales especializados.
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